بومدین پس از رسیدن به دمشق در کنفرانس شرکت کرد ولی اثار بیماری در دمشق بر او ظاهر شد .بومدین بلافاصله پس از پایان کنفرانس در حالیکه وضع جسمی اش بحرانی بود تصمیم گرفت به کشورش بازگردد .
زمانی که بومدین به الجزایر رسید اثار بیماری در او نمایان بود وبلافاصله وی را به بیمارستان منتقل کردند وتحلیل ها وازمایش هائی برای وی انجام دادند .بومدین اعلام کرد پس از خوردن غذای در هواپیما دچار مشکل شده وکنترل خودرا از دست داده است.
همسر رئیس جمهوری الجزایر پیشنهاد کرد که وی را به امریکا برای درمان ببرند ولی بومدین مخالفت کرد وگفت ممکن است سازمان جاسوسی سی ای ای اورا در بیماستان بکشد .پیشنهاد شد که وی را به فرانسه اعزام کنند که رئیس جمهوری با این پیشنها د نیز مخالفت کرد که سرانجام با اعزام وی به شوروی سابق مخالفت نکرد واعلام کرد که اتحاد جماهیر شوری دوست ماست ودر انجا من در امن وامان خواهم بود.
هواری بومدین سرانجام در ۲۷ دسامبر ۱۹۷۸ در اثر شدت بیماری دار فانی را وداع گفت.
